Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms