Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zbed5B2RPU8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbed5B2RPU8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms