Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms