Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf25B1AWN9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf25B1AWN9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms