Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtpruB1AUH1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtpruB1AUH1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtpruB1AUH1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtpruB1AUH1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtpruB1AUH1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtpruB1AUH1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtpruB1AUH1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PtpruB1AUH1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtpruB1AUH1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtpruB1AUH1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PtpruB1AUH1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtpruB1AUH1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms