Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spocd1B1ASB6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spocd1B1ASB6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms