Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930435E12RikA6X8Z9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms