Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E8

Ttll6, Tubulin polyglutamylase TTLL6, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll6A4Q9E8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll6A4Q9E8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms