Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms