Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Plcb2A3KGF7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Plcb2A3KGF7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Plcb2A3KGF7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Plcb2A3KGF7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Plcb2A3KGF7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Plcb2A3KGF7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms