Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Palm3A2TJV2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms