Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf39A2RT81 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms