Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931406B18RikA2RSL7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931406B18RikA2RSL7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931406B18RikA2RSL7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931406B18RikA2RSL7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
4931406B18RikA2RSL7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
4931406B18RikA2RSL7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
4931406B18RikA2RSL7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4931406B18RikA2RSL7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms