Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pramef17A2ASJ1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms