Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VirmaA2AIV2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms