Protein–RNA interactions for Protein: A2AGX3

Prdm11, PR domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm11A2AGX3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm11A2AGX3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm11A2AGX3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms