Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc163A2AGD7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms