Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH1

Ube2dnl1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D N-terminal-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl1A2AFH1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2dnl1A2AFH1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms