Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tmem185aA2AF53 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem185aA2AF53 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms