Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc39aA2ACP1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc39aA2ACP1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc39aA2ACP1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc39aA2ACP1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc39aA2ACP1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc39aA2ACP1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc39aA2ACP1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc39aA2ACP1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc39aA2ACP1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc39aA2ACP1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc39aA2ACP1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc39aA2ACP1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc39aA2ACP1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc39aA2ACP1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc39aA2ACP1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms