Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprfA2A8L5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprfA2A8L5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms