Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul4bA2A432 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms