Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H4

Trbv19, T cell receptor beta, variable 19 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv19A0A0B4J1H4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Trbv19A0A0B4J1H4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv19A0A0B4J1H4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Trbv19A0A0B4J1H4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv19A0A0B4J1H4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv19A0A0B4J1H4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv19A0A0B4J1H4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv19A0A0B4J1H4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv19A0A0B4J1H4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv19A0A0B4J1H4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv19A0A0B4J1H4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv19A0A0B4J1H4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv19A0A0B4J1H4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Trbv19A0A0B4J1H4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv19A0A0B4J1H4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv19A0A0B4J1H4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trbv19A0A0B4J1H4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trbv19A0A0B4J1H4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trbv19A0A0B4J1H4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trbv19A0A0B4J1H4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trbv19A0A0B4J1H4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trbv19A0A0B4J1H4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Trbv19A0A0B4J1H4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Trbv19A0A0B4J1H4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Trbv19A0A0B4J1H4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Trbv19A0A0B4J1H4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Trbv19A0A0B4J1H4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Trbv19A0A0B4J1H4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Trbv19A0A0B4J1H4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Trbv19A0A0B4J1H4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv19A0A0B4J1H4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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