Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXJ7

Larp1b, La ribonucleoprotein domain family, member 1B (Fragment), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Larp1bA0A0A6YXJ7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms