Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms