Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt16Q9Z2K1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt16Q9Z2K1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Krt16Q9Z2K1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Krt16Q9Z2K1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms