Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms