Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cacna2d3Q9Z1L5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms