Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek4Q9Z1J2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms