Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NfkbiaQ9Z1E3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfkbiaQ9Z1E3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfkbiaQ9Z1E3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfkbiaQ9Z1E3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfkbiaQ9Z1E3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NfkbiaQ9Z1E3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfkbiaQ9Z1E3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfkbiaQ9Z1E3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfkbiaQ9Z1E3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfkbiaQ9Z1E3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfkbiaQ9Z1E3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfkbiaQ9Z1E3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfkbiaQ9Z1E3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfkbiaQ9Z1E3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfkbiaQ9Z1E3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfkbiaQ9Z1E3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfkbiaQ9Z1E3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfkbiaQ9Z1E3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfkbiaQ9Z1E3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfkbiaQ9Z1E3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfkbiaQ9Z1E3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfkbiaQ9Z1E3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NfkbiaQ9Z1E3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms