Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F7

Sncg, Gamma-synuclein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncgQ9Z0F7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SncgQ9Z0F7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncgQ9Z0F7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms