Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AireQ9Z0E3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AireQ9Z0E3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AireQ9Z0E3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AireQ9Z0E3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AireQ9Z0E3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AireQ9Z0E3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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