Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV92

Epb41l3, Band 4.1-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l3Q9WV92 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Epb41l3Q9WV92 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epb41l3Q9WV92 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms