Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nme3Q9WV85 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nme3Q9WV85 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nme3Q9WV85 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nme3Q9WV85 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nme3Q9WV85 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nme3Q9WV85 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nme3Q9WV85 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nme3Q9WV85 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nme3Q9WV85 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nme3Q9WV85 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nme3Q9WV85 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nme3Q9WV85 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nme3Q9WV85 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nme3Q9WV85 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nme3Q9WV85 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms