Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec2Q9WV35 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec2Q9WV35 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec2Q9WV35 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec2Q9WV35 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec2Q9WV35 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec2Q9WV35 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec2Q9WV35 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec2Q9WV35 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec2Q9WV35 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec2Q9WV35 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec2Q9WV35 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec2Q9WV35 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec2Q9WV35 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec2Q9WV35 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec2Q9WV35 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec2Q9WV35 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec2Q9WV35 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec2Q9WV35 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms