Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn3Q9WUK7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms