Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pus1Q9WU56 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms