Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp18Q9WTV6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp18Q9WTV6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms