Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TapbpQ9R233 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms