Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed2Q9R0Q3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms