Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N9

Syt9, Synaptotagmin-9, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt9Q9R0N9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt9Q9R0N9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt9Q9R0N9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt9Q9R0N9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt9Q9R0N9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt9Q9R0N9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt9Q9R0N9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt9Q9R0N9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt9Q9R0N9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt9Q9R0N9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt9Q9R0N9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt9Q9R0N9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt9Q9R0N9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt9Q9R0N9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt9Q9R0N9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt9Q9R0N9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt9Q9R0N9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt9Q9R0N9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt9Q9R0N9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syt9Q9R0N9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syt9Q9R0N9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms