Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Plod1Q9R0E2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Plod1Q9R0E2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms