Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms