Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms