Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms