Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndrg3Q9QYF9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms