Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms