Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms