Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWH1

Phc2, Polyhomeotic-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc2Q9QWH1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms