Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdcQ9QW08 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms